Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RNF19A-213ENST00000523481 547 ntTSL 48.53□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 RNF19A-206ENST00000519527 817 ntTSL 33.7□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.795e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 HERC1-205ENST00000559886 2462 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)22.04■■□□□ 1.129e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 ADAM10-216ENST00000561149 529 ntTSL 417.85■□□□□ 0.456e-6■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 ADAM10-215ENST00000560608 587 ntTSL 415.43■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 92.2
SF3B1O75533 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 92.1
SF3B1O75533 AC079594.2-201ENST00000483754 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 92
SF3B1O75533 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 236.56■■■■□ 3.446e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PPP1R37-206ENST00000544069 712 ntTSL 525.72■■□□□ 1.717e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.617e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.596e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MBD6-202ENST00000546632 607 ntTSL 224.1■■□□□ 1.456e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 223.53■■□□□ 1.366e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.347e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.266e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.256e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.226e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 322.21■■□□□ 1.157e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 222.13■■□□□ 1.136e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 AKR7A2-204ENST00000489286 725 ntTSL 521.8■■□□□ 1.086e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.086e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.037e-9■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 320.88■□□□□ 0.936e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PLCD1-208ENST00000495367 567 ntTSL 320.77■□□□□ 0.916e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 AKR7A2-205ENST00000492217 989 ntTSL 220.75■□□□□ 0.916e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 520.54■□□□□ 0.886e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 RIMKLB-201ENST00000299673 2033 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 VGLL4-218ENST00000623028 728 ntTSL 520.5■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 AKR7A2-202ENST00000330072 1171 ntTSL 220.3■□□□□ 0.846e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PLCD1-207ENST00000484829 1044 ntTSL 520.25■□□□□ 0.836e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ANAPC2-207ENST00000495611 747 ntTSL 220.25■□□□□ 0.836e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.826e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DDX50-205ENST00000483593 1067 ntTSL 320.13■□□□□ 0.816e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 220.09■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DPH7-213ENST00000491359 999 ntTSL 220.02■□□□□ 0.86e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 219.97■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MAP7D1-205ENST00000429533 959 ntTSL 319.71■□□□□ 0.756e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ZNF577-208ENST00000638721 556 ntTSL 419.61■□□□□ 0.736e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.711e-20■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 UBN1-207ENST00000589191 705 ntTSL 319.21■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PPFIA1-210ENST00000528284 568 ntTSL 419.02■□□□□ 0.646e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 218.87■□□□□ 0.616e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PKN1-204ENST00000585839 3518 ntTSL 218.69■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PNPLA2-202ENST00000525250 2726 ntTSL 218.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 FHL3-205ENST00000485803 1468 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.546e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 XRRA1-208ENST00000528219 1016 ntTSL 518.38■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MBD6-213ENST00000552255 509 ntTSL 418.1■□□□□ 0.496e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PPP1R12C-208ENST00000592754 827 ntTSL 217.66■□□□□ 0.426e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DPH7-208ENST00000476303 922 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.46e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MGST2-203ENST00000503816 1780 ntTSL 517.47■□□□□ 0.396e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 517.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DPH7-202ENST00000460572 394 ntTSL 517.17■□□□□ 0.346e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MYO19-218ENST00000617189 1990 ntTSL 217.15■□□□□ 0.346e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 317.09■□□□□ 0.336e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 XRRA1-217ENST00000533598 872 ntTSL 316.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 216.64■□□□□ 0.266e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 XRRA1-205ENST00000525407 986 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MBD6-209ENST00000549231 538 ntTSL 416.45■□□□□ 0.226e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 SLC26A6-211ENST00000431739 588 ntTSL 316.26■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ZNF577-207ENST00000638684 473 ntTSL 516.03■□□□□ 0.166e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 ZNF577-216ENST00000640429 453 ntTSL 315.99■□□□□ 0.156e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 515.86■□□□□ 0.136e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 415.66■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 515.52■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.066e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 FN3K-202ENST00000570734 2515 ntTSL 515.27■□□□□ 0.046e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 TOE1-205ENST00000495703 2173 ntTSL 214.95□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 EPCAM-204ENST00000456133 1501 ntTSL 514.84□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 GLCCI1-211ENST00000492797 495 ntTSL 214.43□□□□□ -0.16e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.116e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MBD6-211ENST00000551351 532 ntTSL 414.26□□□□□ -0.136e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.156e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 MAP7D1-206ENST00000462118 776 ntTSL 313.64□□□□□ -0.236e-11■■■■■ 91.9
SF3B1O75533 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 91.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1537.9 ms