Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PRAMEF10O60809 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PRAMEF10O60809 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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