Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLIN3O60664 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms