Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms