Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSI1O43347 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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