Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCAO15360 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCAO15360 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCAO15360 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCAO15360 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms