Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDKO14874 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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