Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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