Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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