Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVV-1B6SEH8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms