Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms