Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms