Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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HDGFL3Q9Y3E1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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HDGFL3Q9Y3E1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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HDGFL3Q9Y3E1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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HDGFL3Q9Y3E1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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