Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms