Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms