Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASIC3Q9UHC3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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