Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD1Q9UGP4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD1Q9UGP4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms