Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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