Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLKQ9UBT6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms