Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms