Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms