Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSD3Q9NYI0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms