Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms