Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms