Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms