Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms