Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA4CQ9C0C4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms