Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms