Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms