Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms