Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms