Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C15orf39Q6ZRI6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms