Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms