Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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MED27Q6P2C8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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MED27Q6P2C8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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MED27Q6P2C8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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MED27Q6P2C8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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MED27Q6P2C8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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