Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms