Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PRRT3Q5FWE3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT3Q5FWE3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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