Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms