Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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COL24A1Q17RW2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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COL24A1Q17RW2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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COL24A1Q17RW2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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COL24A1Q17RW2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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COL24A1Q17RW2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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COL24A1Q17RW2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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