Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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