Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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