Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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ECM1Q16610 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECM1Q16610 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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