Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCSK7Q16549 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms