Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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