Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms