Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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