Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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