Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms