Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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