Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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