Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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